利用粒線體與微衛星分子標記分析臺灣石虎族群遺傳結構

王翎

doi:10.6342/NTU.2014.00085

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利用粒线体与微卫星分子标记分析台湾石虎族群遗传结构

Using Mitochondrial DNA and Microsatellite Markers Analyze the Population Structure of Leopard Cat (Prionailurus bengalensis chinensis) in Taiwan

王翎 , 硕士　　导师：卢道杰;朱有田;袁孝维　　

繁体中文 DOI： 10.6342/NTU.2014.00085

遗传多样性；粒线体分子标记；微卫星分子标记；石虎保育； genetic diversity ； mitochondrial DNA markers ； microsatellite markers ； leopard cat conservation

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摘要 │ 参考文献 (133) │ 国际计量

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Leopard cat （Prionailurus bengalensis） is widely distributed in Asia, and it is a rare species protected by the Wildlife Conservation Law in Taiwan. Many studies have stated that island populations are at the risks of low genetic diversity and extinction. To understand the genetic status of leopard cat populations in Taiwan, this study tried to construct the techniques of genetic analysis. Sixty-eight samples were obtained to analyze mitochondrial DNA markers. The low values of haplotype diversity (H=0.378/0.425 in cytb/D-loop) and nucleotide diversity (π=0.03%/0.12% in cytb/D-loop) revealed that population bottleneck effect may have occurred recently. The leopard cat populations in Taiwan lack geography structure; as a result, the populations with relatively high genetic diversity, like Miaoli and Nantou, should be regarded as key groups to protect. The historical demography of leopard cat populations in Taiwan inferred from the neutrality test, mismatch distribution and Bayesian skyline plot indicated a stable population in the past, but slightly expanded since 5,000 years before present. The subspecies phylogenetic tree divided the populations of leopard cats into two clades. And the leopard cat populations in Taiwan form an independent genetic cluster. Results of this study help to clarify the genetic diversity of leopard cat populations in Taiwan, and served as a fundamental data to leopard cat conservation. For a better explanation of evolutionary history of leopard cats, we should collect more samples from each county and China. Additionally, we successfully selected 13 microsatellite loci with polymorphism, which can be regarded as an effective genetic analysis tool.

参考文献 ( 133 ) 〈TOP〉

吕佳家（2011）苗栗通霄浅山地区自由活动家猫之活动范围和活动模式。国立屏东科技大学野生动物保育研究所硕士论文。70页。
连结：
高嘉孜（2013）苗栗县通霄镇石虎（Prionailurus bengalensis chinensis）之移除模式及冲突探讨。国立屏东科技大学野生动物保育研究所硕士论文。175页。
连结：
许玉玲（2009）通霄地区台湾鼬獾（Melogale moschata subaurantiaca）之活动范围、活动模式与栖地利用。国立屏东科技大学野生动物保育研究所硕士论文。52页。
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刘平妹（2002）贰、亚澳地区的古气候资料汇整会议记要。全球变迁通讯杂志33：4-7。
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Bagatharia, S. B., M. N. Joshi, R. V. Pandya, A. S. Pandit, R. P. Patel, S. M. Desai, A. Sharma, O. Panchal, F. P. Jasmani, and A. K. Saxena (2013) Complete mitogenome of asiatic lion resolves phylogenetic status within Panthera. BMC Genomics 14:572.
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