臺灣長鬃山羊（Capricornis swinhoei）圈養族群於非侵入式遺傳分析暨微衛星標幟開發之探討

張怡穎

doi:10.6342/NTU.2011.01550

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台湾长鬃山羊（Capricornis swinhoei）圈养族群於非侵入式遗传分析暨微卫星标帜开发之探讨

Study on Non-invasive Genetic Analysis and Microsatellite Marker Development in Captive Population of Formosan Serow (Capricornis swinhoei)

张怡颖 , 硕士　　导师：王佩华　　共同指导教授：林恩仲

繁体中文 DOI： 10.6342/NTU.2011.01550

台湾长鬃山羊；圈养族群；非侵入式遗传分析；微卫星标帜；族群结构； Formosan serow ； captive population ； non-invasive genetic study ； microsatellite markers ； genetic structure

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摘要 │ 参考文献 (156) │ 国际计量

摘要〈TOP〉

台湾长鬃山羊为台湾特有种，在国内属珍贵稀有保育动物。为维持其族群之遗传多态性，及未来可能进行域外保育，了解圈养（台北市立动物园）与野外台湾长鬃山羊的遗传现况并避免发生近亲繁殖便成一重要课题。然而台湾长鬃山羊为生性敏感之物种，不易进行捕捉采样；此外，台湾长鬃山羊目前仍欠缺进行个体层级遗传分析之分子标帜，而目前分子标帜中以微卫星标帜较为广泛使用。因此本试验之目的便为建立自台湾长鬃山羊粪样萃取 DNA 之非侵入式分析方法并发展适用於台湾长鬃山羊个体及族群遗传分析之微卫星标帜。
本试验共评估三种保存方法与两种自粪便萃取 DNA 之方法，并进行长达四周之保存试验。试验结果显示保存、萃取方法与保存时间皆显着影响 PCR 效果（P < 0.0001）。在本次试验所测试方法中，粪样以 95% 乙醇保存，并以 2CTAB/PCI 法进行萃取，至少於四周内仍可得最佳 PCR 结果。此法成本低廉且易於操作，除了应用於园内遗传监测之采样外，亦可作为未来野外非侵入式遗传分析之先期研究。
微卫星标帜测试部分，利用来自韩国长鬃山羊与跨物种微卫星标帜虽可初步了解台北市立动物园内之台湾长鬃山羊遗传结构，但可能由於多态性不足（平均 PIC = 0.562），加上严重连锁不平衡情况，无法进一步完成个体监别与亲子监别。
而本研究自行开发之 23 个交替基因个数大於 3 之微卫星标帜，经检测台北市立动物园 43 头台湾长鬃山羊，共有 21 组高多态性微卫星标帜。且於个体监别与亲子监别时，亦优於跨物种微卫星标帜。
整合 6 组跨物种微卫星标帜与 17 组自行开发之微卫星标帜所得之 23 组微卫星标帜进行遗传分析，显示目前台北市立动物园内台湾长鬃山羊族群尚无严重近亲配种情况，但族群已产生些微分化，反映近年来特定配对之配种。此外，个体监别部份，合并之 23 组微卫星标帜可用於建立台北市立动物园内台湾长鬃山羊个体之分子身份识别；亲子监别部份，在已知母畜之情况下，亲缘监别之结果与现有系谱几乎可相互印证（93.5%）。
综合以上所述，合并後的 23 组微卫星标帜在台湾长鬃山羊圈养族群的动物管理上可辅佐动物园现有晶片系统，作为动物样本端或新生仔畜分子身份辨识工具，或用於推测系谱、分析园内个体间之遗传关系，做为园内个体配种参考。配合本试验所建立之非侵入式遗传分析方法，日後或许亦可使用此些微卫星标帜於野外台湾长鬃山羊族群分析，并规划野放或野外引种等措施，以同时维持圈养与野外族群之遗传多态性，达成域外保育之目的。

参考文献 ( 156 ) 〈TOP〉

蔡佳淳。2005。丹大地区台湾长鬃山羊（Nemorhaedus swinhoei）的活动以及原住民之利用方式。硕士论文，国立台湾师范大学，台北。
连结：
An, J. H. 2006. Development and characterization of microsatellite markers for endangered Korean Goral (Nemorhaedus caudatus raddeanus) and its molecular phylogenetic status. Ph. D. Thesis. Seoul National University. Seoul.
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Arif, I. A., A. H. Khan, M. Shobrak, A. A. Homaidan, M. A. Sadoon, and A. H. Farhan. 2010. Measuring the genetic diversity of Arabian Oryx using microsatellite markers: implication for captive breeding. Genes Genet. Syst. 85: 141-145.
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Ballou, J. 1994. Population biology. pp. 93-114. In: Przewalski’s horse: the history and biology of an endangered species. L. Boyd and K. A. Houpt, eds. Suny Press, New York.
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Banks, S. C., M. P. Piggott, B. D. Hansen, N. A. Robinson, and A. C. Taylor. 2003. Demographic monitoring of an entire species (the northern hairy-nosed wombat, Lasiorhinus krefftii) by genetic analysis of non-invasively collected material. Anim. Conserv. 6: 101-107.
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