CPI Distribution and Cutoff Values for Duo Kinship Testing

Chang-En Pu; Adrian Linacre

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doi:DOI 号

来源数据

P232 - 239

医药卫生 > 基础医学

DOI： 10.4077/CJP

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CPI Distribution and Cutoff Values for Duo Kinship Testing

Chang-En Pu ； Adrian Linacre

The Chinese Journal of Physiology ； 50 卷 5 期 (2007 / 10 / 31) ， P232 - 239

英文

forensic science ； short tandem repeat STRs ； paternity ； false inclusion duo ； sensitivity ； specificity

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摘要 │ 参考文献 (11) │ 国际计量

并列摘要〈TOP〉

DNA-based tests commonly use 13 STR (short tandem repeat) loci in human identification and paternity testing-the Combined DNA Index System or CODIS. Its average degree of accuracy of paternity identification is greater than 0.9999 under the circumstance of a mother, a child and a putative father. However, the possibility of false inclusions increases under circumstances such as [1] only two members of a family group are available-a duo case during determination of paternity or [2] identification of human remains while only one living relative is present.
In Taiwan, the National Unidentified Human Remains Database uses the CODIS 13 STR for the identification of family members. Two or more reference samples in the DNA database have been found to share one allele at all loci tested. Then the Combined Paternity Index (CPI) is used to determine and provide an estimate of kinship in such cases. Combining 499,500 sets of DNA data for the 13 STR CODIS loci, totally 431 (0.086%) cases are false inclusions where all 13 loci shared at least one allele. Simulated partial DNA profiles (not all 13 loci yielded results) were created to mimic the mutation and degradation process. All 431 real duo cases were analyzed to evaluate sensitivity and specificity. This report provided four kinship-matching situations with CPI cutoff values when the number of allele-sharing loci exceeded 11. CPI values greater or lesser than the suggested cutoff point will provide a greater degree of confidence in determining whether two samples are derived from first-degree relatives.

参考文献 ( 11 ) 〈TOP〉

Birus, I.,Marcikic, M.,Lauc, D.,Dzijan, S.,Lauc, G.(2003).How high should paternity index be for reliable identification of war victims by DNA typing?.Croat. Med. J.,44,322-326.
Budowle, B.,Moretti, T.R.,Baumstark, A.L.,Defenbaugh, D.A.,Keys, K.M.(1999).Population data on the thirteen CODIS core short tandem repeat loci in African American, U.S. Caucasians, Hispanics, Bahamians, Jamaicans, and Trinidadians.J. Forensic Sci.,44,1277-1286.
Butler, J.M.(2005).Kinship and parentage testing..MA:In: Forensic DNA Typing.
De Ungria, M.C.,Frani, A.M.,Magno, M.M.,Tabbada, K.A.,Calacal, G.C.,Delfin, F.C.,Halos, S.C.(2002).Evaluating DNA tests of motherless cases using a Philippine genetic database.Transfusion,42,954-957.
Gornik, I.,Marcikic, M.,Kubat, M.,Primorac, D.,Lauc, G.(2002).The identification of war victims by reverse paternity is associated with significant risks of false inclusion.Int. J. Legal. Med.,116,255-257.

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